Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zscan5bB2RTN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zscan5bB2RTN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zscan5bB2RTN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan5bB2RTN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan5bB2RTN3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zscan5bB2RTN3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms