Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518bB2RRE4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf518bB2RRE4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf518bB2RRE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf518bB2RRE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms