Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brpf1B2RRD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brpf1B2RRD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms