Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b1B1AZQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b1B1AZQ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b1B1AZQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms