Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PtpruB1AUH1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtpruB1AUH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpruB1AUH1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
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