Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spocd1B1ASB6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spocd1B1ASB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms