Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik3B1AS29 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik3B1AS29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms