Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn8B1ARD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn8B1ARD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms