Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll11A4Q9F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll11A4Q9F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll11A4Q9F4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms