Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r232A2RTT5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r232A2RTT5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms