Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt1lA2RSY6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trmt1lA2RSY6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt1lA2RSY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms