Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms