Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SktA2AQ25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SktA2AQ25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SktA2AQ25 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SktA2AQ25 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms