Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtf1A2AQ19 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtf1A2AQ19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtf1A2AQ19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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