Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700003F12RikA2AKE5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700003F12RikA2AKE5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700003F12RikA2AKE5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
1700003F12RikA2AKE5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700003F12RikA2AKE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms