Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Frmpd1A2AKB4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Frmpd1A2AKB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Frmpd1A2AKB4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Frmpd1A2AKB4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms