Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbbp8nlA2ABX0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbbp8nlA2ABX0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp8nlA2ABX0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms