Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87977A2A958 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C87977A2A958 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87977A2A958 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87977A2A958 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87977A2A958 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87977A2A958 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C87977A2A958 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms