Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprfA2A8L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprfA2A8L5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprfA2A8L5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms