Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsg1A2A825 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsg1A2A825 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsg1A2A825 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms