Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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