Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNU5

E130218I03Rik, RIKEN cDNA E130218I03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,11
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14,28□□□□□ -0,12
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms