Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.7 ms