Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2210011C24RikA0A087WQ89 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210011C24RikA0A087WQ89 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 807.4 ms