Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28510A0A087WP28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28510A0A087WP28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28510A0A087WP28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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