Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5L1

Igkv10-94, Immunoglobulin kappa variable 10-94 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv10-94A0A075B5L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igkv10-94A0A075B5L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igkv10-94A0A075B5L1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igkv10-94A0A075B5L1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms