Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Trbv31A0A075B5J5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv31A0A075B5J5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Trbv31A0A075B5J5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Trbv31A0A075B5J5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv31A0A075B5J5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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