Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms