Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtmr1Q9Z2C4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms