Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms