Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc1bQ9WV32 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc1bQ9WV32 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms