Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Chst4Q9R1I1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chst4Q9R1I1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms