Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms