Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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