Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prkab1Q9R078 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prkab1Q9R078 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prkab1Q9R078 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkab1Q9R078 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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