Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms