Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms