Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ap3b2Q9JME5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms