Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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