Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ybx3Q9JKB3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms