Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms