Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms