Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim39Q9ESN2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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