Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tlr1Q9EPQ1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms