Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnft1Q9DCN7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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