Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hmg20aQ9DC33 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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