Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms