Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy3Q9DAU1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy3Q9DAU1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms