Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms