Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms